浙江大學蛋白質組學專題研習班(第7期)招生簡章
各高校及相關科研單位:
蛋白質組學研究是生命科學的新興前沿領域,是生命科學進入后基因組時代的標志之一。近年來,隨著蛋白質組學、生物信息學與質譜分析技術的快速發展,誕生了一系列與蛋白質相關的數據庫資源及生物信息學分析工具,在研究蛋白質的鑒定、結構分析與模擬、蛋白與核酸相互作用、與蛋白-蛋白相互作用、分子對接,乃至分子相互作用網絡等各個層面為科學研究提供助力。
為進一步幫助廣大科研工作者快速掌握提升蛋白質組學原理、實驗設計以及后期數據分析技能,浙江大學歷經20年的“基因組科學研習班”品牌項目原班人馬聯合浙江大學多位長期從事蛋白質組學研究的老師及景杰生物資深生信專家傾情推出“
蛋白質組學專題研習班”,通過理論授課與上機實踐相結合的方式,每人一臺PC機,緊隨大屏幕演示“跟我學”操作。
培訓內容:蛋白質組學背景介紹、質譜分析基礎、蛋白組學實驗基礎與思路、蛋白質組學數據處理、MaxQuant蛋白質組學數據處理(上機實踐)、蛋白組組學生物信息學分析、蛋白質組學數據分析及可視化(上機實踐)、蛋白質組學功能數據的挖掘(上機實踐)、蛋白質組學研究案例說明等。
培訓時間:2023年12月18-22日(18日為報到日,19日起上課)。
培訓對象:從事生命科學、農學、醫學等領域科研工作者和高校教師及研究生。
培訓地點:杭州 浙江大學
注冊方式:
(1)培訓費:4200元/人(包含注冊費、資料費、上機實踐費)。
培訓期間食宿自理,會務組可幫助預定。
(2)繳費方式(指定賬號)
賬戶名稱:浙江大學
賬戶號(開戶行):19042201040000014(農行杭州市浙大支行紫金港分理處)
匯款用途處寫明:姓名+上機號(由會務組在回執確認函中提供)
(3)會務組聯系方式:
余老師 19116332108 沈老師 13958194424
會務組郵箱:
genetrain@sina.com、
genetrain@zju.edu.cn
填寫報名表并于報到前發送至會務組郵箱,上機實踐主辦方配備電腦。如有其它要求,請在備注中說明。
(4)非匯款學員可現場刷卡(含公務卡)或現金交納
(5)研習班期間食宿費用自理,會務組可以代為預定住宿,您也可自行安排住宿。
a,漢庭酒店(浙大紫金港店),浙江省杭州市西湖區紫荊花北路188號(近浙江大學紫金港校區)。標準間房價:260元/間/天(含早);
b,紫金港國際飯店,浙江省杭州市西湖區申花路796號(近浙江大學紫金港校區)。標準間房價:398元/間/天(含早);
證書發放:
浙江大學第7期蛋白質組學專題研習班課程安排
日 期 |
時 間 |
內 容 安 排 |
12月18日(2023年) |
全 天 |
杭州 浙江大學紫金港校區報到(詳見報到通知) |
19日
(周二) |
08:30~11:30 |
蛋白質組學背景介紹
系統生物學與蛋白組學發展史
蛋白組的復雜性與動態變化特征
蛋白組學研究展望 |
14:00~17:00 |
質譜分析基礎
質譜技術發展與常見質譜類型簡介
質譜數據采集與譜圖解析
多肽的質譜定性定量分析 |
20日
(周三) |
08:30~11:30 |
蛋白組學實驗基礎與思路
常見比較蛋白組學流程與設計思路
常見樣本處理流程
特殊樣本的處理流程
標記與非標記策略
多肽的分級與分離
其他樣本前處理策略 |
14:00~17:00 |
MaxQuant蛋白質組學數據處理(上機實踐)
MaxQuant軟件及數據處理流程介紹
LFQ、iBAQ、譜圖計數法非標定量
SILAC標記定量
TMT標記定量
結果查看與導出
Persues統計處理與可視化 |
21日
(周四) |
08:30~11:30 |
蛋白質組學功能數據的挖掘(上機實踐)
R語言基礎
GO與KEGG通路分析
基于String數據庫的蛋白互作分析
基于Cytoscape的互相作用可視化 |
14:00~17:00 |
蛋白質組學數據分析及可視化(上機實踐)
GSEA功能富集分析
磷酸化激酶預測分析
泛素化E3連接酶預測分析
藥物靶預測分析
蛋白三維結構與口袋預測 |
22日
(周五) |
08:30~11:30 |
蛋白組組學生物信息學分析
蛋白質功能注釋
蛋白質組學標準分析
蛋白質組學臨床應用
蛋白修飾組學分析
多組學聯合分析 |
14:00~17:00 |
蛋白質組學研究案例說明
從科學問題到研究閉環
臨床大樣本與分子分型-以大隊列研究為例
翻譯后修飾與腫瘤代謝-以新型酰化修飾為例
蛋白質組未來應用展望 |
本課表僅供參考,課程順序以報到當天發放課表為準。
培訓班主要師資簡介
鐘伯雄 教授 博士生導師
浙江大學動物科學學院教授,開展了家蠶絲腺蛋白質組、以及與野蠶后部絲腺的比較蛋白質組學研究,發現蠶繭優質高產主要是核糖體蛋白代謝通路提高;(2)開展了蛋白翻譯后修飾研究,明確了與蠶繭優質高產相關的蛋白質磷酸化特征;(3)建立了高效轉基因方法,采用TALEN技術在家蠶胚胎時期成功獲得基因定點插入研究結果、采用CRISPR-Cas9技術成功突變家蠶重要功能基因,獲得穩定遺傳突變品種(4)開展了micRNA研究工作,揭示了家蠶絲腺micRNA表達特征。(5)開展了家蠶生物反應器研究,獲得了機械性能優良的家蠶蜘蛛復合絲新材料。在JPR、BMC Genomics、IBMB、遺傳學報、蠶業科學等國內外雜志發表相關論文160多篇。
郭 成 副研究員 碩士生導師。
以第一作者/通訊作者在Analytical Chemistry, Analytica Chimica Acta等期刊上發表SCI論文28篇,以合作作者身份在Nature,JACS等期刊上發表SCI論文多篇。ACS等出版社十余種SCI期刊審稿人。承擔國家自然科學基金面上項目、青年基金、浙江省自然科學基金等科研項目多項,作為科研骨干參與國家自然科學基金杰出青年基金、重點項目等。
趙祖相嵐 博士
哈爾濱醫科大學生物信息學碩士,博士畢業于澳門大學生物醫學專業,研究方向為乳腺癌單細胞測序分析,蛋白因子調控與激素作用機制。具有多年組學分析經驗,擅長課題方案設計、生物信息學分析思路規劃。目前主要從事臨床腫瘤大樣本蛋白基因組、翻譯后修飾調控、多種修飾crosstalk等方向的研究。在多組學聯合分析、蛋白基因組建庫、生信算法整合、分析流程搭建、數據挖掘與機制探索等方面具有豐富的理論基礎與實踐經驗。數據分析與方法學論文主要發表在Cell reports, EMBO reports, BMC bioinformatics, Nuclear Acid Research, Oncogene等雜志。
孫強強 博士
博士畢業于武漢大學,博士期間從事感染免疫、抗感染治療機制研究。在蛋白組學、空間組學、多組學及蛋白質翻譯后修飾等領域有豐富的研究及項目經驗。闡明了迄今為止發現的第一個同時調節病原體乳酸代謝及免疫逃逸的轉錄因子,并解釋了代謝途徑調節模式如何根據不同宿主生態位演變,對預防和治療感染提供了重要的理論和醫療意義,并為新型藥物開發提供了潛在的靶點。目前,學術論文在Nature Communications, eLife, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Molecular Microbiology等發表。
張佳輝 高級工程師
福建醫科大學獲得生物信息學碩士學位。主要課題利用基因表達相對穩定的秩序關系尋找消化道腫瘤早期診斷、預后相關的biomarker。累計參與大型分析項目30余個,學術論文共同作者15余篇。從事多組學相關的生信工作近5年,具有大量多組學數據分析經驗,涉及多癌型、單一癌型不同亞型、多器官、不同生理發育階段等。對數據挖掘及作圖可視化有豐富實戰經驗,合作文章產出累計影響因子達80+。
趙二杰 高級工程師
畢業于哈爾濱醫科大學基礎七年制,主攻生物信息學方向,擅長大樣本多組學數據分析和R語言開發。主導生信算法模塊的研發與落地,完成搭建多個新型修飾類算法模塊與分析流程,涉及分析內容包含機器學習識別臨床生物標志物、蛋白基因組整合分子分型分析、新型修飾數據挖掘、調控酶關聯分析等方向。具有豐富的臨床多組學大隊列項目分析經驗與修飾組學研發經歷,申報修飾類分析專利多項。
金鑫 高級工程師
碩士畢業于東北林業大學細胞生物學專業,從事植物蛋白質組學方向研究,主要內容為植物逆境脅迫的蛋白質組學與生理學分析,揭示植物抗逆的分子機制。主要從事樣品制備相關工作,負責樣品制備流程的搭建,制備方法的開發與優化,樣品制備自動化體系的建立等內容。對各類樣本的制備路線及技術流程具有非常豐富的經驗,曾對多種不同類型樣本進行方法開發和流程優化等工作。
參考附件:報名回執表