BSI攜PEAKS系列新版本軟件亮相美國第72屆ASMS大會

瀏覽次數：1774　發布日期：2024-6-11　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

2024年6月2日-6月6日，第72屆美國質譜年會（ASMS）在美國阿納海姆隆重舉行！BSI攜最新版本的PEAKS®系列軟件與DeepImmu®免疫肽組發現服務、PEAKS AB®多克隆抗體測序服務新品亮相大會！

PEAKS® 新版本軟件亮點

全面支持ThermoFisher Hybrid-DIA、AB SCIEX ZT Scan DIA數據的快速、準確分析；
支持Bruker TimsTOF ddaPASEF抗體測序數據分析。
DeepNovo® Peptidome workflow算法升級，全面支持DDA和DIA數據的免疫肽組分析。
免疫肽組分析支持基因關聯、序列變異和翻譯后修飾位點鑒定。
PEAKS DB search通過深度學習提升MS2評分，鑒定數量提升10%。
DIA數據分析性能大幅提升，速度更快、更靈敏、更準確，更好的短梯度數據分析支持。

會議期間，CTO辛磊博士受邀參加了深度學習從頭測序算法的技術研討會，在會上分享了PEAKS®算法團隊在de novo sequencing領域多年的工作成果，以及deep learning技術當下的應用及對未來的展望。作為首個將深度學習應用到de novo sequencing的算法模型，BSI的DeepNovo®也得到后續眾多算法的借鑒與引用。

此外，對于近幾年大熱的免疫多肽研究，會場的相關墻報幾乎也成了PEAKS®專場。來自Helmboltz Institute of Translational Oncology Mainz，Genentech，The Children's Hospital of Philadelphia，Baylor college of Medicine, Roche， ADA Forsyth Institute，Regeneron等臨床機構、制藥公司，學術單位展示了他們利用PEAKS的DeepNovo Peptidome或者de novo sequencing工作流在免疫多肽組發現中的數據分析應用。蒙特利爾大學的Pierre Thibault教授也在口頭報告中分享了他們在非小細胞肺癌方面利用PEAKS進行的相關工作成果。

本次會議BSI及百蓁生物共展出6張墻報，涉及新抗原發現方法和流程，多抗測序方法，從頭測序算法，數據統計等方面，引起了眾多業內同行的興趣并討論。TP 566 An AI-driven, proteogenomics-based and complete workflow for novel neoantigen discovery
Authors: Qing Zhang [1], Kyle Hoffman [1], Sahar Rabinoviz [1], Peng Chao [2], Haibo Bian [1], Wenting Li [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China
ThP 058 A Bayesian model for estimating the posterior error probability and the false discovery rate of de novo peptide sequencing
Authors: Hieu Tran [1], Rui Qiao [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ONWP 047 Revolutionizing Proteomics: Ultra-Fast, High-Accuracy Peptide Sequencing with Enhanced GraphNovo AlgorithmAuthors: Zeping Mao [1], Lei Xin[1], Shengying Pan [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
WP 704 Combining Top-Down and Bottom-Up Mass Spectrometry Paves the Way for High Throughput Polyclonal Antibody Sequencing
Authors: Lei Xin [1], Peng Chao [2], Jun Ma [2], Shuyang Zhang [1], Zihao Wang [1], Wenting Li [1], Kyle Hoffman [1], Ailee Aihemaiti [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China
MP 451 Confident identification of proteome-wide low-level mutations using PEAKS 11.5
Authors: Kyle Hoffman [1], Julie Genereaux [2], Lei Xin [1], Zia Rahman [1], Christopher J Brandl [2], Patrick O’Donoghue [2], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Western University, London, ON
TP 576 Distinguishing MIPs in the cell surface or in processing by MS with Immunoprecipitation and Mild Acid Elution methods
Authors: Chao Peng[1], Ping Wu[1], Haofei Miao[1], Ling Li[1], Baozhen Shan [2]
[1] BaizhenBio (Wuhan) Inc., Hubei, China
[2] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON

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作為生物信息學的領軍企業，BSI專注于蛋白質組學和生物藥領域，通過機器學習和先進算法提供世界領先的質譜數據分析軟件和蛋白質組學服務解決方案，以推進生物學研究和藥物發現。我們通過基于AI的計算方案，為您提供對蛋白質組學、基因組學和醫學的卓越洞見。旗下著名的PEAKS^®️系列軟件在全世界擁有數千家學術和工業用戶，包括：PEAKS^®️ Studio，PEAKS^®️ Online，PEAKS^®️ GlycanFinder, PEAKS^®️ AB，DeepImmu^®️免疫肽組發現服務和抗體綜合表征服務等。
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