導讀

免疫學研究一直都是生命科學領域學術前沿，發表的文章也幾乎都是Cell、Natrue、Science及其子刊寵兒。尤其是近些年，全球各實驗機構無論是疫苗、抗體、小分子藥物的研究，還是病理學研究等等，免疫學相關研究方案更是成為了一大熱門。

本篇小鹿將分享3篇發表于免疫學TOP期刊Frontiers in Immunology的項目文章，運用DIA蛋白組學和雙平臺代謝組學優勢，更好地助力您榮登免疫學期刊！！

 

文章一

 

甲狀腺毒癥小鼠的衰老特征：營養不良，免疫衰老與脂毒性

期刊：Frontiers in Immunology

影響因子：8.786

發表時間：2022年6月

樣本類型：小鼠

合作項目單位：魯南制藥集團股份有限公司

運用組學技術：LC-MS非靶代謝組學、GC-MS非靶代謝組學、DIA蛋白質組學（皆由鹿明生物提供技術支持）

 

研究背景

本篇由魯南制藥集團股份有限公司馮芹和張貴民研究員課題組發表的文章，通過LC/GC-MS雙平臺代謝組學和DIA蛋白質組學研究方法，描繪了血清蛋白質組和內源性代謝圖譜，發現了小鼠甲狀腺毒癥與衰老特征，探究了甲狀腺毒癥與衰老疾病的機理，為探究衰老機制及抗衰老藥物的研發提供了理論依據。

 

研究思路

 

研究結論

文章通過LC-MS和GC-MS非靶代謝組學聯合DIA蛋白質組學方法，檢測甲狀腺毒癥小鼠的血清蛋白和脂質代謝物等，并從營養、代謝、免疫、內分泌角度分析甲狀腺毒癥與衰老疾病的關系。研究發現脂質代謝紊亂、營養不良、免疫衰老和脂毒性，是引發衰老相關疾病的機制。通過本研究不僅可用于衰老相關疾病的預防，也可用于新藥的研發。

 

文章二

 

腸道菌群通過短鏈脂肪酸酸調節實驗性自身免疫性前列腺炎Th17/Treg細胞分化

期刊：Frontiers in Immunology

影響因子：8.786

發表時間：2022年7月

樣本類型：小鼠

合作項目單位：安徽醫科大學第一附屬醫院泌尿外科

運用組學技術：16s rRNA測序和非靶向/靶向代謝組學（皆由鹿明生物提供技術支持）

 

研究背景

免疫失衡在發病機制中發揮了重要作用。因此，CP/CPPS也被認為是一種器官特異性的自身免疫性疾病。T淋巴細胞，特別是CD4+T細胞，被發現是CP/CPPS發病機制的主要貢獻者，Th17細胞是CD4+T細胞的一個子集，據報道，Th17細胞與多種自身免疫性疾病的發生密切相關。

本篇由安徽醫科大學第一附屬醫院泌尿外科梁朝朝教授課題組在《Frontiers in Immunology》（IF：8.796）期刊發表的研究成果，本研究運用糞便16s rRNA測序和非靶向/靶向代謝組學等研究方法分析了EAP小鼠腸道微生物組和代謝產物，以研究EAP中腸道微生物群和相關代謝物的豐度是否發生改變，從而發現腸道菌群通過其代謝物對EAP小鼠模型中免疫反應調節的影響。

杜和喜、岳少宇、牛迪為第一作者，梁朝朝、張力、陳先國、李春為共同通訊作者，歐易/鹿明生物提供該項目糞便16s rRNA測序和非靶向/靶向代謝組學相關工作。

 

研究思路

 

研究結論

本研究為了揭示腸道菌群是否影響CP/CPPS，及其背后的潛在機制，通過皮下免疫建立了一個實驗性自身免疫性前列腺炎(EAP)小鼠模型，運用糞便16srRNA測序和非靶向/靶向代謝組學，探索腸道菌群在免疫穩態和自身免疫性疾病的發展中的作用機制，為在飲食干預中補充微生物終產物來改善CP/CPPS患者的免疫障礙提供了一個新的視角。

 

文章三

 

人參固本對甲狀腺素毒癥小鼠的抗衰老作用：改善免疫衰老、低蛋白血癥、脂毒性和腸道菌群

期刊：Frontiers in Immunology

影響因子：8.786

發表時間：2022年10月25日

樣本類型：小鼠

合作項目單位：魯南制藥集團，山東大學齊魯醫院

運用組學技術：DIA蛋白組學、LC-MS非靶向代謝組學、16s微生物測序（由鹿明生物提供技術支持）

 

研究背景

本文由魯南制藥聯合山東大學在 Frontiers in Immunology期刊發表的研究成果，魯南制藥集團馮芹博士為第一作者，魯南制藥集團張貴民研究員和山東大學齊魯醫院劉德山教授為共同通訊作者。研究采用流式細胞技術、DIA蛋白質組學，糞便代謝物學、植物代謝組學和微生物組學等研究方法，研究人參固本（RSGB）口服液對甲狀腺毒癥加速衰老小鼠模型的影響。

結果表明，RSGB恢復了中性粒細胞和淋巴細胞的數量，增強了淋巴細胞的功能，提高了補體和抗菌肽的水平，表明RSGB在細胞和分子水平上提高了甲狀腺毒癥小鼠的免疫力。RSGB 通過改善貧血、低白蛋白血癥、離子轉運蛋白和維生素結合蛋白來糾正甲狀腺毒癥小鼠的營養不良。

 

研究思路

 

研究結論

本研究采用常規檢測方法結合多組學技術，研究人參固本（RSGB）口服液對甲亢加速衰老小鼠模型的影響。對于血液和血清，文章采用了流式細胞確定免疫衰老表型，采用生化檢驗和DIA蛋白組學確定RSGB 治療顯著改善了甲狀腺毒癥小鼠的防御能力和營養不良。比較特別之處，本文采用LC-MS非靶向植物代謝組學解析特有代謝產物。文章還運用關聯分析技術，挖掘和歸納作用機制。文章為中藥的現代化研究提供路線，為中藥的臨床應用價值挖掘提供思路，值得借鑒和推廣。

 

鹿明生物DIA蛋白組產品線

DIA相比于DDA的大的優勢在于高效測定復雜樣品中豐度極低的蛋白分子，極大地提高了定量分析的可信度。其原理是在質譜數據采集時，高速、循環的將每個采集窗口內的所有母離子及其子離子碎裂后進行全掃描，而非根據母離子信號強度篩選后進行二級碎片再掃描。

 

因此DIA具有的優勢：

• 高通量

• 高分辨率

• 高可重現性

• 定量準確

 

而且DIA樣本無需分級上機，極大的縮短了每個樣品的檢測時間，適合大樣本量的蛋白質組研究。但由于DIA獲得的是幾乎沒有丟失的所有離子信息，數據量及其復雜性大大增加，數據分析難度加大。目前主流的數據分析是基于 DDA/DIA 構建的譜庫和實驗產生的數據對樣品中的蛋白質進行鑒定和定量。為了有更好的鑒定結果，還需要通過實驗樣本建立DDA參考數據庫。