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生物芯片點樣儀和掃描儀助EZH2基因在肺癌發(fā)生機制中的研究

瀏覽次數(shù):790 發(fā)布日期:2024-11-5  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
Arrayjet生物芯片點樣儀和Innopsys生物芯片掃描儀助力EZH2基因在肺癌發(fā)生機制中的研究

EZH2(Enhancer of Zeste Homolog 2)是PRC2(Polycomb Repressive Complex 2,多梳抑制復合體2)的一個亞基,可對催化組蛋白H3的27位賴氨酸K27進行甲基化修飾,具有轉(zhuǎn)錄抑制的作用。目前相當比例的非小細胞肺癌臨床病患中出現(xiàn)了EZH2過表達的情況,一些研究也證實了EZH2 驅(qū)動的癌細胞代謝重編程可誘發(fā)腫瘤發(fā)生和惡化。然而現(xiàn)有研究多基于2D細胞培養(yǎng)模型而非3D立體結(jié)構(gòu),無法充分評估腫瘤微環(huán)境的各種影響。

美國肯塔基大學環(huán)境與系統(tǒng)生物化學中心的研究團隊于2023年11月在《The Journal of Biological Chemistry》雜志發(fā)表了文章《Metabolic reprogramming driven by EZH2 inhibition depends on cell–matrix interactions》。在該項研究中,作者利用A549細胞分別構(gòu)建2D和3D細胞模型,并轉(zhuǎn)染病毒knock down EZH2基因,對細胞在降低EZH2基因表達水平后在不同模型中的差異評估。
  • 實驗方法:
1.在A549細胞中轉(zhuǎn)染 shGFP、A6 或 A9 病毒,構(gòu)建EZH2 knock down細胞(shGFP為對照組,A6或A9為knock down(kd)組)。

2.構(gòu)建細胞模型:水凝膠中構(gòu)建EZH2 kd的3D細胞模型 ,液體培養(yǎng)基構(gòu)建貼壁2D細胞模型。
3.免疫熒光染色和同位素示蹤法評估細胞生長情況。

4.裂解、提取細胞蛋白,使用Arrayjet 生物芯片點樣儀點印在硝酸纖維素玻片上,制成反向蛋白陣列(RPPA)芯片,封閉后用染色試劑雜交。通過法國Innopsys公司的innoScan 710 AL生物芯片掃描儀獲取雜交后的芯片數(shù)據(jù),用Innopsys的Mapix軟件分析結(jié)果。
  • 實驗結(jié)果:
1.EZH2 kd 對2D 模型中細胞侵襲能力的影響較;而在3D 球體模型中, EZH2 kd則能夠顯著降低細胞的侵襲能力。

2.EZH2 kd在3D細胞模型中抑制糖酵解過程,并增強克雷布斯循環(huán)循環(huán)和γ-氨基丁酸代謝,但在 2D 細胞模型中無顯著效果。(圖1)

3.EZH2 kd在3D細胞模型中會引起磷酸戊糖途徑和嘌呤核苷酸的補救合成,但在2D模型中無明顯類似效果。

4.總體上,EZH2 kd會抑制2D肺癌細胞生長,但對于3D球狀細胞生長卻具有相反作用。

圖1 EZH2  knock down在3D細胞球模型中增強克雷布斯循環(huán)循環(huán)和γ-氨基丁酸代謝,抑制糖酵解過程,但對于2D細胞模型無明顯效果
 
  • 實驗結(jié)論:
本研究說明,EZH2 對 A549 細胞的生長及相關(guān)中央代謝網(wǎng)絡的調(diào)節(jié)程度取決于細胞-細胞和細胞-基質(zhì)的相互作用。與2D細胞模型相比,EZH2抑制了在 3D 球狀體中引發(fā)的克雷布斯循環(huán)循環(huán)、γ-氨基丁酸代謝和嘌呤核苷酸的補救合成,這與它在 3D 球狀體中的最終觀察結(jié)果一致。因此EZH2不僅通過已知的甲基化方式沉默基因,而且也通過改變細胞外基質(zhì)和調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境來影響癌癥發(fā)展,需要在未來的研究中予以重視。 
Arrayjet位于英國愛丁堡,專注于提供生物芯片應用領(lǐng)域的解決方案及服務。自2000年公司成立即致力于開發(fā)新型生物樣品噴點方案–噴墨式液體處理平臺,該系統(tǒng)于2006年上市,目前用戶遍布全球27個國家。


 
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Innopsys 成立于1999年。總部位于法國,一直致力于生物醫(yī)學領(lǐng)域相關(guān)儀器和軟件的自主研發(fā)和生產(chǎn)。Innoscan系列掃描儀,采用先進的共聚焦PMT檢測器和多激光掃描光路,可以同時進行多通道熒光檢測。不僅有效降低了熒光光漂白現(xiàn)象以及信號損失,還可以有效縮短掃描時間。在基因組和蛋白組表達,基因突變,SNP檢測,CGH,細菌病毒檢測,腫瘤特異性標志篩查,病理組織篩查等方面都有非常廣泛的應用。 

環(huán)亞生物,生命科學產(chǎn)品全國性代理商,不斷把國外頂級的創(chuàng)新產(chǎn)品引入中國。環(huán)亞生物具備完善的公司運營、產(chǎn)品管理、營銷、售前技術(shù)支持和售后維修體系。環(huán)亞生物作為Innopsys芯片分析儀和Arrayjet芯片點樣儀大中華區(qū)代理商,負責Innopsys和Arrayjet產(chǎn)品大中華區(qū)的營銷和售后支持。

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