非接觸DNA打斷儀對(duì)全基因組DNA樣品處理的操作流程及注意事項(xiàng)
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/strong>對(duì)全基因組DNA樣品進(jìn)行100-500bp區(qū)間的片段化處理
實(shí)驗(yàn)設(shè)備：非接觸DNA打斷儀XM-M220(單槽)
基因組DNA樣品超聲打斷的實(shí)驗(yàn)步驟：
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng)，設(shè)置溫度為4℃。
2.將每個(gè)0.2mL EP管加入130μL濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
3.將2管裝好樣品的0.2mL EP管分別放入儀器的適配器當(dāng)中，其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP管補(bǔ)齊。
4.程序設(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s 間隔時(shí)間10s，總時(shí)長(zhǎng)分別為3分鐘和4分鐘。
5.程序結(jié)束后，取出樣品使用毛細(xì)管電泳進(jìn)行基因組片段化檢測(cè)。
打斷完的毛細(xì)管電泳檢測(cè)結(jié)果圖：
1.程序設(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s 間隔10s，總時(shí)長(zhǎng)4分鐘
2.平均片段大小：266 bp，99-503 bp區(qū)間占比 89.33%。
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)：
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng)，設(shè)置溫度為4℃
2.試用TPX材質(zhì)的EP管，管子的材質(zhì)影響超聲打斷效果。
3.客戶(hù)在做實(shí)驗(yàn)時(shí)一定要讓跟隨著老師一起做實(shí)驗(yàn)，不然后續(xù)結(jié)果不理想無(wú)法分析出原因。
非接觸超聲波DNA打斷儀采用等溫、旋轉(zhuǎn)離心管及非接觸的方式對(duì)樣品進(jìn)行打斷勻漿和混合。通過(guò)球面固態(tài)超聲換能器將聲波以三維方式聚焦到樣本區(qū)域，聚焦聲波能夠以不同角度的能量輸入獲得良好的處理效果。
實(shí)驗(yàn)設(shè)備：非接觸DNA打斷儀XM-M220(單槽)
基因組DNA樣品超聲打斷的實(shí)驗(yàn)步驟：
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng)，設(shè)置溫度為4℃。
2.將每個(gè)0.2mL EP管加入130μL濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
3.將2管裝好樣品的0.2mL EP管分別放入儀器的適配器當(dāng)中，其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP管補(bǔ)齊。
4.程序設(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s 間隔時(shí)間10s，總時(shí)長(zhǎng)分別為3分鐘和4分鐘。
5.程序結(jié)束后，取出樣品使用毛細(xì)管電泳進(jìn)行基因組片段化檢測(cè)。
打斷完的毛細(xì)管電泳檢測(cè)結(jié)果圖：
1.程序設(shè)置：溫度4℃，超聲工作時(shí)間20s 間隔10s，總時(shí)長(zhǎng)4分鐘
2.平均片段大小：266 bp，99-503 bp區(qū)間占比 89.33%。
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)：
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng)，設(shè)置溫度為4℃
2.試用TPX材質(zhì)的EP管，管子的材質(zhì)影響超聲打斷效果。
3.客戶(hù)在做實(shí)驗(yàn)時(shí)一定要讓跟隨著老師一起做實(shí)驗(yàn)，不然后續(xù)結(jié)果不理想無(wú)法分析出原因。
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發(fā)布者：上海凈信實(shí)業(yè)發(fā)展有限公司
聯(lián)系電話(huà)：021-57790908/57790918/33886881
E-mail：service@tissuelyser.com
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