01 CID/HCD
碰撞誘導(dǎo)解離( Collision Induced Dissociation, CID ) ，也稱為碰撞活化解離(Collision Activation Dissociation, CAD ) ，基本原理是母離子進入質(zhì)譜后，在電場中加速以增加離子動能，然后與中性分子（通常是氦、氮或氬）碰撞。在碰撞過程中，部分動能轉(zhuǎn)化為內(nèi)能，導(dǎo)致肽骨架的化學(xué)鍵斷裂，形成碎片離子。高能碰撞解離 (High-Energy Collision Dissociation，HCD)與CID原理相同，一般在Orbitrap類儀器中使用。CID/HCD主要產(chǎn)生靠近肽段N端的b離子和靠近C端的y離子，是自下而上的蛋白質(zhì)組學(xué)中最主流的碎裂方式（圖1）。

02 ECD
電子捕獲解離（Electron capture dissociation，ECD）與傳統(tǒng)的串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)互補，主要用于FT-ICR質(zhì)譜。二硫鍵通常對振動解離穩(wěn)定，但在 ECD 中優(yōu)先斷裂，快速且具有特異性，且不穩(wěn)定的翻譯后修飾和非共價鍵在主鏈鍵解離后也能保持完整。結(jié)合ECD，可以實現(xiàn)更高的序列覆蓋，在一定能量下，也可以區(qū)分異亮氨酸和亮氨酸。ECD 的主要應(yīng)用領(lǐng)域包括DNA預(yù)測蛋白質(zhì)序列的Top-down驗證、從頭測序、二硫鍵分析以及翻譯后修飾分析。
03 ETD/EAD
電子轉(zhuǎn)移解離（Electron Transfer Dissociation，ETD）通過將陰離子基團的電子轉(zhuǎn)移到多肽陽離子上來誘導(dǎo)肽段碎裂。由于ETD會誘導(dǎo)肽/蛋白質(zhì)主鏈上酰胺鍵的斷裂，因此會產(chǎn)生互補的c離子和z離子（圖3）。由于ETD和CID/HCD產(chǎn)生的序列信息是互補的，因此通常會結(jié)合這兩種方法，以提高序列覆蓋率和翻譯后修飾的鑒定（如糖基化）。

電子活化解離（Electron Activation Dissociation，EAD）是基于自由電子轉(zhuǎn)移實現(xiàn)肽段碎裂的，調(diào)節(jié)EAD電子能量可適用從單電荷小分子到多電荷大分子的檢測。低能量EAD可用于top down表征完整蛋白的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)屬性。中能量EAD可以保留PTMs的關(guān)鍵離子。高能EAD可用于小分子（如內(nèi)源性代謝物或藥物代謝產(chǎn)物）的特異性鑒定。

04 UVPD
Tips
PEAKS^®軟件對多種碎片離子產(chǎn)生的譜圖均做了算法優(yōu)化，以實現(xiàn)更高的譜圖解析率，并且支持在同一個工作流中同時分析多個不同類型的數(shù)據(jù)。在讀取數(shù)據(jù)時，用戶根據(jù)分析需求設(shè)定即可。


我們將持續(xù)更新蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)基礎(chǔ)知識，感興趣的您敬請持續(xù)關(guān)注哦！
若您想深入了解PEAKS軟件相關(guān)功能和應(yīng)用，歡迎底部聯(lián)系方式提交您的咨詢信息！ 作為生物信息學(xué)的領(lǐng)軍企業(yè)，BSI專注于蛋白質(zhì)組學(xué)和生物藥領(lǐng)域，通過機器學(xué)習(xí)和先進算法提供世界領(lǐng)先的質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件和蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)解決方案，以推進生物學(xué)研究和藥物發(fā)現(xiàn)。我們通過基于AI的計算方案，為您提供對蛋白質(zhì)組學(xué)、基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)的卓越洞見。旗下著名的PEAKS®️系列軟件在全世界擁有數(shù)千家學(xué)術(shù)和工業(yè)用戶，包括：PEAKS®️ Studio，PEAKS®️ Online，PEAKS®️ GlycanFinder, PEAKS®️ AB，DeepImmu®️ 免疫肽組發(fā)現(xiàn)服務(wù)和抗體綜合表征服務(wù)等。
聯(lián)系方式：021-60919891；sales-china@bioinfor.com