SPRi表面等離子共振技術(shù)助力發(fā)現(xiàn)靶向生物膜結(jié)構(gòu)的多糖靶點
瀏覽次數(shù):362 發(fā)布日期:2025-5-13
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生物膜由附著在兩個表面和彼此間的微生物細胞和胞外聚合物(EPSs,如胞外 DNA、胞外多糖、蛋白質(zhì)等生物分子)構(gòu)成,能保護病原體免受免疫反應(yīng)和傳統(tǒng)抗生素治療的影響,產(chǎn)生耐藥性。目前,80% 的細菌和真菌感染與生物膜形成有關(guān),使得生物膜相關(guān)疾病的治療面臨巨大挑戰(zhàn)。多糖胞間粘附素(PIA)是多種微生物產(chǎn)生的關(guān)鍵生物膜成分,最初以N - 乙;木 - β - 1,6 - N - 乙酰葡糖胺(PNAG)生物形式合成,經(jīng)脫乙;纬沙墒斓陌舛嗵。脫乙;瘜τ诰S持PIA的正常功能、表面附著和生物膜形成至關(guān)重要,例如在表皮葡萄球菌和金黃色葡萄球菌中,IcaB 蛋白對 PNAG 脫乙;切纬蓤怨糖揖哂卸拘缘腜IA相關(guān)生物膜的前提條件。由于缺乏研究PIA的有效試劑和技術(shù),對PIA多糖鏈中脫乙酰化的程度、位置和方式都尚不明確。盡管針對 PIA 的研究有一定進展,如抗 PNAG 單克隆抗體 F598 已進入二期臨床,對多種致病性微生物有強結(jié)合能力,在動物模型中也顯示出一定療效,且合成的脫乙;疨NAG在疫苗開發(fā)方面表現(xiàn)出明顯優(yōu)勢,但這些成果仍無法滿足臨床需求。

文章題目為“Insights into biofilm architecture and maturation enable improved clinical strategies for exopolysaccharide-targeting therapeutics”于2024年12月發(fā)表在Cell Chemical Biology雜志,作者來自美國國家癌癥研究所化學生物學實驗室。
該團隊使用生物芯片點樣儀將873種不同的糖復(fù)合物(PNAG、糖蛋白、糖肽、糖脂、聚糖等)點印在PolyAn 2D環(huán)氧修飾的功能化玻片上,并使用125 - 200μg/mL的單克隆抗體TG10和F598孵育,隨后使用Cy3標記的熒光二抗結(jié)合,結(jié)果采用Innopsys熒光掃描儀進行統(tǒng)計分析,數(shù)據(jù)顯示抗體有良好的選擇性,僅對PNAG有相互作用。在對PNAG多糖序列設(shè)計時,主要針對5個不同的PNAG乙酰化位點,數(shù)字1代表乙酰化,0代表去乙;l(fā)現(xiàn)抗體TG10主要結(jié)合去乙;疨NAG、抗體F598主要結(jié)合乙酰化PNAG,如圖1

圖1:根據(jù)乙;潭葞щ姾傻牟煌O(shè)計出32種不同PNAG,其與抗體結(jié)合后的熒光結(jié)果統(tǒng)計圖
繼而對抗體的結(jié)合動力學進行分析,使用芯片點樣儀將59種聚糖樣品和對照(濃度為1mg/mL的PBS溶液)打印到Plexera SPRi芯片表面。點印區(qū)域14mm×14mm,樣品重復(fù)打印4次,形成一個15×16的微陣列。打印完成后,芯片在真空環(huán)境下避光干燥過夜,然后用 365nm UV光照射15分鐘進行光交聯(lián)。交聯(lián)后,用PBS和去離子水對芯片進行清洗,之后將其組裝到流動池中,并放入儀器中進行測試。以1xPBS含1% BSA作為運行緩沖液,調(diào)整SPRi的光學位置,待基線穩(wěn)定后開始結(jié)合實驗。將抗體注入流動池,設(shè)定250秒的結(jié)合時間和600秒的解離時間,流速為2mL/s。使用甘氨酸-HCl(10mM, pH2.0)作為再生緩沖液。為了獲得完整的滴定曲線,使用稀釋法將抗體濃度設(shè)定在100nM 至0.78nM的范圍內(nèi)進行檢測。結(jié)果使用Plexera SPR Data Analysis 軟件(Plexera)和 GraphPad Prism 10 (Dotmatics)進行分析,發(fā)現(xiàn)TG10和PNAG(00000)之間的KD值為9.7±0.6 nM,如圖2。

圖2:PlexArray HT儀器采用SPRi方法進行動態(tài)結(jié)合動力學過程分析,給不同濃度的TG10進行結(jié)合檢測,發(fā)現(xiàn)隨著劑量與結(jié)合的去乙酰化PNAG成正比(圖C),給予定量100 nM TG10與32種不同的PNAG動力學檢測(圖D),不同濃度的TG10與去乙酰化PNAG (00000) 的結(jié)合效果(圖E)
研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),生物膜內(nèi) PIA 存在高度乙;兔撘阴;牟煌瑓^(qū)域,且這些區(qū)域在生物膜成熟過程中呈現(xiàn)動態(tài)變化,且能特異性結(jié)合高度脫乙;疨NAG的單克隆抗體 TG10,與臨床二期試驗中的 F598 抗體結(jié)合特性互補,分別識別生物膜中不同乙;癄顟B(tài)的PIA區(qū)域。研究深化了對PIA結(jié)構(gòu)和成熟過程的理解,為開發(fā)靶向PIA的治療藥物、完善疫苗和診斷試劑的設(shè)計提供了重要依據(jù)。
原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2024.11.005
Arrayjet位于英國愛丁堡,專注于提供生物芯片應(yīng)用領(lǐng)域的解決方案及服務(wù)。Mercury系列微量-皮升級/納升級點樣儀產(chǎn)品采用獨特的飛行噴墨點樣技術(shù)實現(xiàn)行業(yè)第一的快速、非接觸式微量液體處理。同時上萬種不同樣品可以進行快速點樣,更低的上樣體積可有效減少樣品損失,使您的珍貴樣品物盡其用。
Innopsys 成立于1999年?偛课挥诜▏恢敝铝τ谏镝t(yī)學領(lǐng)域相關(guān)儀器和軟件的自主研發(fā)和生產(chǎn)。Innoscan系列掃描儀,采用先進的共聚焦PMT檢測器和多激光掃描光路,可以同時進行多通道熒光檢測。在基因組和蛋白組表達,腫瘤特異性標志篩查,病理組織篩查等方面都有非常廣泛的應(yīng)用。
普芯生物,源于美國Lumera(2003年成立)生物檢測部,2009年P(guān)lexera 成立,致力于研發(fā)無標記高通量SPRi系統(tǒng)和芯片藥物篩選技術(shù),2018年推出第一代PlexArray HT 并不斷迭代,2023底年正式推出由蘇州普芯在國內(nèi)自主研發(fā)、國內(nèi)硬件生產(chǎn)和組裝同時重新設(shè)計軟件系統(tǒng)的PlexArray HT Ultra系列。
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