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Nature—瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院:光遺傳學(xué)的創(chuàng)新性結(jié)合揭示腸癌機(jī)制

瀏覽次數(shù):133 發(fā)布日期:2025-6-3  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
 導(dǎo)讀
在癌癥研究領(lǐng)域,如何精準(zhǔn)模擬腫瘤發(fā)生的時(shí)空動(dòng)態(tài)一直是未解難題。傳統(tǒng)的二維培養(yǎng)和動(dòng)物模型要么缺乏生理復(fù)雜性,要么難以實(shí)時(shí)追蹤細(xì)胞變化。本文由瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院(EPFL)Matthias P. Lutolf團(tuán)隊(duì)主導(dǎo),聯(lián)合瑞士癌癥研究所以及巴塞爾羅氏創(chuàng)新中心等機(jī)構(gòu)完成,發(fā)表于《自然》(Nature)。通訊作者L. Francisco Lorenzo-Martín和Matthias P. Lutolf長(zhǎng)期致力于干細(xì)胞生物工程與腫瘤微環(huán)境研究,其團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的器官芯片技術(shù)在模擬組織生理復(fù)雜性領(lǐng)域具有國(guó)際領(lǐng)先地位。

研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地將微流控芯片技術(shù)光遺傳學(xué)工具組織工程方法結(jié)合,開(kāi)發(fā)出具有拓?fù)渖飳W(xué)復(fù)雜性的體外微型結(jié)腸模型(mini-colons)。

重要發(fā)現(xiàn)
光遺傳學(xué)驅(qū)動(dòng)的體外腫瘤發(fā)生模擬
光控Cre重組酶系統(tǒng):從基因到表型的時(shí)空精準(zhǔn)操控
研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的OptoCre系統(tǒng)是一種基于藍(lán)光響應(yīng)的基因編輯工具,其核心在于將Cre重組酶的表達(dá)與光信號(hào)耦合。該系統(tǒng)包含三個(gè)關(guān)鍵組件:

rtTA轉(zhuǎn)錄因子:組成性表達(dá),與多西環(huán)素結(jié)合后激活下游元件;
GAVPO蛋白:在多西環(huán)素存在時(shí)表達(dá),藍(lán)光照射下與Cre重組酶結(jié)合并激活其功能;
熒光報(bào)告基因:通過(guò)GFP標(biāo)記突變細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平的實(shí)時(shí)追蹤。

在實(shí)驗(yàn)中,研究人員將OptoCre導(dǎo)入攜帶Apc、Kras、Trp53突變的結(jié)腸類(lèi)器官(AKP模型),通過(guò)藍(lán)光照射(100μW/cm²,3小時(shí))誘導(dǎo)特定細(xì)胞的致癌重組。結(jié)果顯示,藍(lán)光照射區(qū)域的細(xì)胞迅速啟動(dòng)突變程序,而未照射區(qū)域保持正常,證明該系統(tǒng)具有亞細(xì)胞級(jí)的空間控制精度。

迷你結(jié)腸:光遺傳學(xué)與微流控技術(shù)的完美融合
傳統(tǒng)類(lèi)器官因結(jié)構(gòu)封閉、壽命短,難以模擬腫瘤長(zhǎng)期演化。而微流控迷你結(jié)腸通過(guò)支架引導(dǎo)的類(lèi)器官形態(tài)發(fā)生,形成了類(lèi)似體內(nèi)結(jié)腸的開(kāi)放管腔結(jié)構(gòu),具備三大優(yōu)勢(shì):
長(zhǎng)期培養(yǎng)能力:無(wú)需傳代即可維持?jǐn)?shù)周,允許觀(guān)察腫瘤從啟動(dòng)到侵襲的完整時(shí)間線(xiàn);
細(xì)胞空間分區(qū):隱窩區(qū)域富集干細(xì)胞(Lgr5+、SOX9+),管腔側(cè)分布分化細(xì)胞(FABP1+),重現(xiàn)體內(nèi)組織極性;
光信號(hào)穿透性:透明水凝膠支架允許藍(lán)光均勻照射,結(jié)合光掩膜技術(shù)可精準(zhǔn)定位突變區(qū)域(如僅照射<0.5%的細(xì)胞)。

通過(guò)OptoCre與迷你結(jié)腸的結(jié)合,研究團(tuán)隊(duì)首次在體外觀(guān)察到:

早期細(xì)胞競(jìng)爭(zhēng):突變細(xì)胞在藍(lán)光照射后24-72小時(shí)內(nèi)經(jīng)歷凋亡高峰,但少數(shù)細(xì)胞逃逸并進(jìn)入快速增殖狀態(tài);

腫瘤形態(tài)發(fā)生:從息肉樣結(jié)構(gòu)(5-10天)逐步演變?yōu)榍忠u性腫瘤,表達(dá)CD44+癌癥干細(xì)胞標(biāo)記,與體內(nèi)腺癌組織學(xué)特征高度吻合。

腫瘤異質(zhì)性的光控解析
利用光掩膜技術(shù),研究人員對(duì)比了隱窩和管腔上皮細(xì)胞作為腫瘤起始位點(diǎn)的差異:
隱窩起源腫瘤:呈現(xiàn)致密結(jié)構(gòu),富含干細(xì)胞標(biāo)記(Lgr5+、SOX9+),轉(zhuǎn)錄譜與體內(nèi)癌癥干細(xì)胞高度相似;
管腔起源腫瘤:形成囊性結(jié)構(gòu),分化標(biāo)記(FABP1+)表達(dá)較高,增殖能力較弱。

這一結(jié)果表明,腫瘤起始微環(huán)境決定了其形態(tài)和功能異質(zhì)性,而光遺傳學(xué)技術(shù)為解析這種“環(huán)境-基因型”互作提供了可控平臺(tái)。

創(chuàng)新與亮點(diǎn)
技術(shù)突破:從“黑箱”到“透明實(shí)驗(yàn)室”
傳統(tǒng)腫瘤研究依賴(lài)動(dòng)物模型,面臨三大瓶頸:
時(shí)空分辨率不足:無(wú)法實(shí)時(shí)追蹤單細(xì)胞動(dòng)態(tài);
倫理與成本:動(dòng)物實(shí)驗(yàn)周期長(zhǎng)、成本高,且難以大規(guī)模篩選;
生理相關(guān)性差:二維培養(yǎng)或簡(jiǎn)單類(lèi)器官無(wú)法模擬組織復(fù)雜性。
光遺傳學(xué)與迷你結(jié)腸的結(jié)合突破了上述限制:
時(shí)空操控革命:藍(lán)光照射可在分鐘級(jí)激活突變,配合延時(shí)攝影實(shí)現(xiàn)“腫瘤發(fā)生電影”的全程記錄;
生理相關(guān)性躍升:迷你結(jié)腸包含8種主要細(xì)胞類(lèi)型,覆蓋干細(xì)胞、分化細(xì)胞和分泌細(xì)胞,其轉(zhuǎn)錄譜與體內(nèi)結(jié)腸組織的相關(guān)性達(dá)89%;
高通量潛力:微流控裝置可并行培養(yǎng)多個(gè)迷你結(jié)腸,結(jié)合自動(dòng)化成像系統(tǒng),適合大規(guī)模藥物篩選。

科學(xué)價(jià)值:揭開(kāi)腫瘤起始的“黑匣子”
該研究首次在體外復(fù)現(xiàn)了結(jié)直腸癌的多階段演化模型,并通過(guò)光遺傳學(xué)技術(shù)驗(yàn)證了關(guān)鍵科學(xué)假設(shè):
腫瘤起始的“細(xì)胞死亡-逃逸”假說(shuō):突變?cè)缙诘募?xì)胞凋亡是清除異常細(xì)胞的關(guān)鍵機(jī)制,而逃逸細(xì)胞的克隆擴(kuò)張依賴(lài)WNT信號(hào)通路激活;
代謝微環(huán)境的調(diào)控作用:通過(guò)光控誘導(dǎo)不同分化狀態(tài)的細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)谷胱甘肽過(guò)氧化物酶GPX2是維持癌癥干細(xì)胞干性的關(guān)鍵因子,其抑制劑硫普羅寧可顯著抑制腫瘤形成;
菌群代謝物的遠(yuǎn)程調(diào)控:利用迷你結(jié)腸的開(kāi)放管腔,證實(shí)膽汁酸代謝物脫氧膽酸可通過(guò)管腔側(cè)接觸促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng),而丁酸等抑癌代謝物則通過(guò)相同路徑發(fā)揮作用。

總結(jié)與展望
光遺傳學(xué)迷你結(jié)腸模型的誕生,標(biāo)志著腫瘤研究進(jìn)入“精準(zhǔn)操控”的新紀(jì)元。這項(xiàng)技術(shù)通過(guò)光信號(hào)將基因編輯、細(xì)胞追蹤與組織工程無(wú)縫整合,不僅在體外復(fù)現(xiàn)了腫瘤發(fā)生的時(shí)空復(fù)雜性,更賦予研究者“主動(dòng)創(chuàng)造”腫瘤微環(huán)境的能力。盡管當(dāng)前模型尚未整合免疫細(xì)胞與血管系統(tǒng),且對(duì)多階段突變的模擬仍需優(yōu)化,但它已在藥物篩選(如GPX2抑制劑驗(yàn)證)、個(gè)性化醫(yī)療(患者類(lèi)器官藥敏測(cè)試)等領(lǐng)域展現(xiàn)出顛覆性潛力。未來(lái),隨著光遺傳學(xué)工具的迭代(如近紅外光激活系統(tǒng))與類(lèi)器官技術(shù)的升級(jí)(血管化、神經(jīng)支配),這種“可編程”的體外腫瘤模型有望成為替代動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的核心平臺(tái),讓癌癥研究從“依賴(lài)偶然觀(guān)察”轉(zhuǎn)向“設(shè)計(jì)驅(qū)動(dòng)發(fā)現(xiàn)”,最終為攻克腫瘤異質(zhì)性與精準(zhǔn)醫(yī)療提供關(guān)鍵鑰匙。

聲明:本文僅用作學(xué)術(shù)目的。
文章來(lái)源于:
Lorenzo-Martín LF, Hübscher T, Bowler AD, Broguiere N, Langer J, Tillard L, Nikolaev M, Radtke F, Lutolf MP. Spatiotemporally resolved colorectal oncogenesis in mini-colons ex vivo. Nature. 2024 May;629(8011):450-457.

DOI:10.1038/s41586-024-07330-2.

發(fā)布者:羅輯技術(shù)(武漢)有限公司
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