文章標題：A pan-cancer single-cell RNA-seq atlas of intratumoral B cells
期刊：Cancer Cell
影響因子：48.8
文章摘要：腫瘤浸潤性B細胞在腫瘤的發生、發展和預后中起著重要作用，但目前缺乏一個全面的分類系統。該研究構建了首個涵蓋多種癌癥的腫瘤內B細胞和漿細胞的單細胞RNA測序（scRNA-seq）圖譜。研究人員識別了關鍵的B細胞亞群特征，鑒別出十個不同的B細胞和漿細胞亞群，并揭示了它們與免疫檢查點抑制劑治療反應的關聯。該研究還通過空間分析驗證了圖譜衍生的B細胞基因簽名，并探索了B細胞與T細胞之間的獨特配體-受體相互作用。此外還發布了一個公開可用的Shiny工具，使研究人員能夠交互式地探索圖譜數據。
 

頂刊文獻二 02
標題：Cancer Cell丨通過CTLA4阻斷能夠克服肺癌腦轉移中酪氨酸激酶抑制劑耐藥性

文章標題：Overcoming tyrosine kinase inhibitor resistance in lung cancer brain metastasis with CTLA4 blockade
期刊：Cancer Cell
影響因子：48.8
文章概要：肺癌腦轉移（LCBM）由于對酪氨酸激酶抑制劑（TKI）治療產生的耐藥性，成為臨床上的重大挑戰。該研究對手術獲得的具有不同遺傳背景和TKI治療史的 LCBM 樣本進行了單細胞 RNA 測序分析。研究發現發現酪氨酸激酶抑制劑（如奧希替尼）會重塑肺癌腦轉移免疫微環境，在增加T細胞浸潤的同時造成免疫檢查點CTLA4的高表達，導致免疫逃逸。該研究進一步在肺癌腦轉移動物模型中證實了靶向治療和CTLA4單抗聯合用藥能夠有效激活T細胞，克服免疫逃逸，為臨床克服肺癌腦轉移靶向治療耐藥問題提供了新方案。
 

頂刊文獻三 03
標題：Nat Rev Cancer丨研究早期癌癥生物學的新興策略

文章標題：Emerging strategies to investigate the biology of early cancer
期刊：Nature Reviews Cancer
影響因子：72.5
文章概要：該綜述文章系統總結了癌癥發生及早期演進的最新研究進展和研究新策略，涵蓋了臨床樣本、自發成瘤小鼠、類器官及干細胞等腫瘤早期演進研究模型，結合單細胞、空間組學和深度學習等技術，精確描繪了腫瘤早期演進過程中克隆選擇、關鍵分子事件及影像特征。深入探討了這些研究策略的優勢和局限，并對未來發展作出展望。
 

頂刊文獻四04
標題：Cell丨單細胞 RNA 測序數據差異表達分析的矩量框架方法
 

文章標題：Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
期刊：Cell
影響因子：45.5
文章概要：單細胞RNA測序（scRNA-seq）數據的差異表達分析對于表征實驗因素如何影響基因表達分布至關重要。目前區分生物和技術來源的細胞間變異性以及評估細胞組之間定量比較的統計顯著性仍然具有挑戰性。該研究推出了Memento，一個用于從scRNA-seq數據中進行均值表達、變異性和基因相關性的穩健且高效的差異分析工具，能夠擴展到數百萬個細胞和數千個樣本。Memento識別出的均值表達顯著性和可重復性差異均超過現有方法，它還識別了變異性和基因相關性的差異。
 

頂刊文獻五 05
標題：Nat Immunol丨炎癥性腸病中抗腫瘤壞死因子治療的縱向單細胞圖譜

文章標題：A longitudinal single-cell atlas of anti-tumour necrosis factor treatment in inflammatory bowel disease
期刊：Nature Immunology
影響因子：27.7
文章概要：免疫介導的炎癥性疾病（IMID）的精準醫學需要細胞對治療反應的理解。描述了在接受抗腫瘤壞死因子（anti-TNF）治療的克羅恩病（CD）和潰瘍性結腸炎（UC）患者中建立的治療圖譜。研究人員從216個腸道活檢樣本（41名受試者）生成了約100萬個單細胞轉錄組，細分成109種細胞狀態，揭示了疾病特異性差異。
 

頂刊文獻六 06
標題：Immunity|巨噬細胞驅動兒童型高級別膠質瘤疾病發展

文章標題：Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
期刊：Immunity
影響因子：25.5
文章概要：該研究探討了巨噬細胞在兒童型高級別膠質瘤（pHGGs）疾病發展中的作用。研究發現，彌漫性中線膠質瘤（DMGs）中的腫瘤相關巨噬細胞（TAM），包括腦內小膠質細胞和單核細胞來源的巨噬細胞，對腫瘤生長有顯著影響。通過單細胞RNA測序和免疫組織化學分析，作者發現特定腫瘤驅動突變塑造了TAM的免疫浸潤和轉錄譜。此外，趨化因子Ccl8和Ccl12在髓細胞中的表達對TAM的浸潤和腫瘤進展有重要影響。研究結果表明，抑制趨化因子受體CCR1和CCR5可以有效減少TAM浸潤，延長患者生存期。這些發現為pHGGs的治療提供了新的理論依據和潛在的治療靶點。
 

頂刊文獻七07
標題：Cancer Cell丨Midkine是與年齡相關和增加乳腺腫瘤發生的驅動因素

文章標題：Midkine as a driver of age-related changes and increase in mammary tumorigenesis
期刊：Cancer Cell
影響因子：48.8
文章概要：該研究通過單細胞多組學探究了大鼠乳腺中與年齡相關的變化。研究發現老年大鼠上皮增生的增加，腔特性的喪失，幼稚B細胞和T細胞的減少。此外，還發現了一種老年大鼠特有的腔祖細胞群，能夠反映癌前病變，并確定Midkine（Mdk）是一種隨著年齡上調的基因，是與年齡相關的腔祖細胞的調節因子。人的血液和乳腺上皮細胞中的Midkine水平隨著年齡的增長而增加，而正常乳腺組織中較高的MDK與年輕女性較高的乳腺癌風險相關。研究結果揭示了衰老和腫瘤發生易感性之間的聯系，并確定了Midkine是年齡依賴性乳腺腫瘤發生增加的中介。