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文庫片段篩選技術流程

瀏覽次數:582 發布日期:2025-3-19  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
磁珠進行核酸片段篩選的步驟基于SPRI技術和磁場分離原理,通過磁珠與DNA片段的特異性結合實現目標片段的分離。以下是具體操作流程及關鍵要點:

一、實驗準備
  1. 磁珠平衡
    將磁珠從冰箱取出,室溫平衡至少30分鐘,避免低溫破壞表面修飾基團。
  2. 試劑配制
    • 現用現配80%無水乙醇(體積比8:2)。
    • 根據目標片段大小選擇磁珠比例(參考各廠家磁珠分選比例表)。

二、雙輪分選法(適用于NGS文庫構建)
第一輪:去除大片段(右側清除)
  1. 磁珠與樣本混合
    按比例(如0.8×)加入磁珠至DNA溶液中,渦旋混勻或移液器吹打10次,室溫孵育5分鐘。
  2. 磁場分離
    短暫離心后置于磁力架(如達遠辰光磁力架),待溶液澄清(約5分鐘),轉移上清至新管,殘留2μL液體于原管底部,避免吸到磁珠。
第二輪:去除小片段(左側清除)
  1. 加入第二輪磁珠
    按比例(如0.2×)加入磁珠至第一輪上清中,重復混勻、孵育步驟。
  2. 磁場分離與洗脫
    • 分離后棄上清,用80%乙醇漂洗磁珠2次(每次30秒)。
    • 室溫干燥磁珠至剛出現龜裂(約5分鐘),避免過度干燥。
    • 加入ddH₂O或TE洗脫DNA,室溫孵育5分鐘后回收上清。

三、單側分選法(適用于去除短片段)
  1. 調整磁珠比例
    根據目標片段長度選擇磁珠用量(如去除≥1000bp片段用0.6×,去除≥200bp用2.0×)。
  2. 結合與分離
    • 混勻磁珠與樣本后孵育5分鐘,磁力架分離并棄上清。
    • 乙醇漂洗后洗脫DNA,適用于去除引物二聚體或短片段雜質。

四、關鍵注意事項
  1. 分選精度控制
    • 第一輪棄磁珠,第二輪棄上清,確保目標片段被保留。
    • 使用Qsep、Agilent 2100 Bioanalyzer驗證分選后片段分布。
  2. 操作誤差規避
    • 轉移上清時使用200μL+10μL槍頭,防止吸到磁珠。
    • 初始體積≥100μL,不足時補超純水以減少移液誤差。

五、應用場景示例
  • NGS文庫構建:通過雙輪分選獲得300-500bp目標片段。
  • 病原體檢測:快速分離特定長度的病毒核酸片段。
如需具體磁珠比例表或實驗參數,可參考廠商提供的說明書(如UltraBio™ II DNA磁珠分選指南)。
發布者:深圳達遠辰光科技有限公司
聯系電話:0755-86727654
E-mail:marketing@longlightech.com

標簽: 磁珠分選
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